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????? 溫室自動控制系統在溫室實時控制中的應用有局限性。溫室自動控制系統對溫室環境因子進行實時監控，不同于開發單純的溫室自動控制系統，其中涉及與控制系統的接口問題。因此，在開發溫室農業專家控制系統時，對農業知識的表達及推理策略等要認真考慮。同時，將更多的農業知識用于溫室生產的實時控制中.不僅僅局限于對環境因子的專家指導。例如通過圖象處理等技術使系統具備自動病蟲害診斷等功能，將使溫室農業專家控制系統的智能化程度更高。
　　
???? ?溫室自動控制采集數據的束縛：至今為止，溫室控制技術還主要停留在對溫室環境因子的監控上，并沒有考慮溫室作物本身的生理過程，諸如植株的溫度，光合作用和蒸騰作用等。事實上，溫室中的CO2濃度將根據植株光合作用的情況來決定.用蒸騰作用的實際數據來決定水分和營養液的供給量,根據植株溫度的測量值來進行溫室內的環境控制等.而且溫室自動控制這些測量值將不斷與最佳作物生長模塊中的值進行比較,這些值之間的不同就可能造成作物生長發育過程中的不良結果,這也就對溫室控制技術提出了更高的要求。
　　
???? ?農業溫室自動控制自身存在的問題，農業專家系統的技術還不十分成熟。由專家整理出來的知識大多屬于這個領域的淺層知識。形式上也主要是條件規則型知識，而且目前各種專家系統在收集$整理農業專家知識時并沒有把專家是如何學習和獲得這些知識的過程整理出來，這樣開發的專家系統并不具有真正的學習能力，結果導致溫室自動控制系統應用時只能處理人類專家見過的各種情況，不能隨機應變。